Μετά την ολοκλήρωση την προκριματικής φάσης, αναδείχτηκαν οι 20 ομάδες που θα συμμετάσχουν στη League Phase του Κυπέλλου Ελλάδας. Οι 13 προέρχονται από τη Super League, καθώς ο μόνος που έμεινε εκτός ήταν ο Πανσερραϊκος.
Αναλυτικά οι ομάδες που θα αγωνιστούν για πρώτη φορά με το νέο τρόπο διεξαγωγής της διοργάνωσης είναι:
Ολυμπιακός
Παναθηναϊκός
ΠΑΟΚ
ΑΕΚ
Αρης
Αστέρας Τρίπολης
Ατρόμητος
ΟΦΗ
Λεβαδειακός
Παναιτωλικός
Βόλος
ΑΕΛ
Κηφισιά
Ηλιούπολη
Αιγάλεω
Καβάλα
Athens Kallithea
Μαρκό
Ελλάς Σύρου
Ηρακλής
Στα πέναλτι ο Ηρακλής τον Πανιώνιο
Ο Ηρακλής προκρίθηκε στη League Phase του Κυπέλλου Ελλάδας επικρατώντας στα πέναλτι του Πανιωνίου, σε αναμέτρηση μεταξύ των δύο ιστορικών ομάδων στη Νέα Σμύρνη. Η κανονική διάρκεια ολοκληρώθηκε με το ισόπαλο 1-1 κι έτσι το ματς οδηγήθηκε απευθείας στη διαδικασία των πέναλτι όπου οι «κυανέρυθροι» προηγήθηκαν 2-0, όμως απέτυχαν σε τρεις διαδοχικές εκτελέσεις κι έτσι ο Ηρακλής νίκησε 3-2 με τον Θεοδόση Μαχαίρα να ευστοχεί στο τελευταίο και καθοριστικό.
Επίσης, στην επόμενη φάση πέρασαν οι δύο ομάδες που στην περσινή σεζόν αγωνίζονταν στη Γ΄ εθνική. Η Ελλάς Σύρου νίκησε 1-0 το Νέστο Χρυσούπολης στο «Ζηρίνειο» και η Μαρκό επικράτησε με το ίδιο σκορ των Χανίων στην Βέροια. Στη League Phase θα αγωνιστεί και η Athens Kallithea που επιβλήθηκε 1-0 του Καμπανιακού στη Χαλάστρα.
Αναλυτικά τα αποτελέσματα στις αναμετρήσεις για την προκριματική φάση του κυπέλλου Ελλάδας:
ΔΕΥΤΕΡΑ 18/8 Μακεδονικός-Λεβαδειακός 1-2 Νίκη Βόλου-Παναιτωλικός 1-2 ΤΡΙΤΗ 19/8 ΠΑΣ Γιάννινα-Βόλος 0-4 Καλαμάτα-ΑΕΛ 1-2 Αναγ. Καρδίτσας-Κηφισιά 1-1 (2-3 στα πέναλτι) Αιγάλεω-Παναργειακός 1-1 (6-5 στα πέναλτι) Καβάλα-Πανσερραϊκός 1-1 (5-4 στα πέναλτι) ΤΕΤΑΡΤΗ 20/8 Καμπανιακός-Ath. Kallithea 0-1 Πανιώνιος-Ηρακλής 1-1 (2-3 στα πέναλτι) Χανιά-Μαρκό 0-1 Ελλάς Σύρου-Νέστος 1-0